Silhueta de pessoa indiferenciada

Hugo Rafael Cardoso Oliveira

Investigador auxiliar convidado
Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano
Subsistema
Investigadores
Unidade ID
Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano
Regime
Exclusividade
Vínculo
CT em Funções Públicas a termo resolutivo certo
Hugo Rafael Cardoso Oliveira. Concluiu o(a) Doutoramento em PhD in Archaeology em 2011 pelo(a) University of Cambridge, Mestrado em MPhil in Archaeology em 2007 pelo(a) University of Cambridge e Licenciatura em Licenciatura em Biologia Aplicada em 2003 pelo(a) Universidade do Minho Escola de Ciências. É Investigador Auxiliar (carreira) no(a) Universidade do Algarve - Campus de Gambelas e Investigador Associado no(a) Universidade do Algarve. Publicou 18 artigos em revistas especializadas. Possui 4 capítulo(s) de livros. Recebeu 10 prémio(s) e/ou homenagens. Participa e/ou participou como Bolseiro de Pós-Doutoramento em 1 projeto(s) e Investigador responsável em 1 projeto(s). Atua na(s) área(s) de Humanidades com ênfase em História e Arqueologia com ênfase em Arqueologia, Ciências Naturais com ênfase em Ciências Biológicas com ênfase em Botânica, Ciências Agrárias com ênfase em Biotecnologia Agrária e Alimentar com ênfase em Seleção com Base em Marcadores Moleculares e Ciências Naturais com ênfase em Ciências Biológicas com ênfase em Biologia da Evolução das Espécies. Nas suas atividades profissionais interagiu com 35 colaborador(es) em coautorias de trabalhos científicos.

Atividades

Atividades
Membro de associação. Comissão Especializada do Senado Académico para Assuntos Disciplinares..
Membro de associação. Senado Académico da Universidade do Algarve. Representative of the R&D staff. .
2022/11 - Presente. Participação em evento. Invited Speaker for the Intern/Resident Medical Training Programme of the Medical Genetics College of the Ordem dos Médicos, under the topic “Arqueogenética e o Prémio Nobel da Medicina e Fisiologia de 2022 – Svante Pääbo”. Coordinator: João Paulo F. S. Oliveira, Faculdade de Medicina, Universidade do Porto. . Simpósio. Arqueogenética e o Prémio Nobel da Medicina e Fisiologia de 2022 – Svante Pääbo. Ordem dos Médicos.
Membro de associação. ICArEHB Board of Direction . Member of the Board of Direction.
2022 - Presente. Participação em evento. Contributed to the production of the board game “InMoz: a Aventura para o conhecimento”, created by Ana Gomes within an FCT project PTDC/HAR-ARQ/28148/2017 https://ccvalg.pt/inmoz/inmozPT.html . Encontro. Centro Ciência Viva do Algarve.
2021/09 - Presente. Organização de evento. Coordinated and participated in ICArEHB stand at Noite Europeia dos Investigadores (2021). Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2021 - Presente. Participação em evento. Speaker in the 4th session of ICArEHB Dialogues: ‘Origins of Agriculture’ (with Dorian Fuller and Hugo Oliveira, convened by Roz Gillis). http://www.icarehb.com/origins-of-agriculture/ . Seminário. ICArEHB Dialogues: ‘Origins of Agriculture’. Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2021 - Presente. Participação em evento. Invited Speaker at FIC.A Festival Internacional de Ciência (October 2021, Oeiras), with a talk intitled “Comerás o teu pão: arqueologia, genómica e as origens da agricultura.”.
https://www.youtube.com/watch?v=uQzEiup88qw&ab_channel=FIC.A-FestivalInternacionaldeCi%C3%AAncia
. Festival. FIC.A Festival Internacional de Ciência. Camara Municipal Oeiras.
2022/02/01. Entrevista (jornal / revista). Speaker in the Geneticamente Falando Com… Q&A seminar sessions of the Sociedade Portuguesa de Genética with a talk intitled "O ópio do povo: genómica, arqueologia e a domesticação da papoila-dormideira" (February 2022). . Sociedade Portuguesa de Genética.
2023. Entrevista (jornal / revista). News Feature of the Proceedings of the National Academy of the USA (PNAS) with the tittle “Unearthing the origins of agriculture”. (PNAS, April 5, 2023; 120 (15) e2304407120).
2023. Entrevista (jornal / revista). News Feature of the science news website Live Science with the title “Who were the first farmers?”.. Live Science.
2020 - Presente. Entrevista / Programa (rádio / tv). “90 Segundos de Ciência”, a radio show (Antena 1) aimed at communicating science and research made in Portugal. . Legume domestication.
2021. Entrevista (jornal / revista). Research project covered in an article in the UAlgZine review nr. 13 “A Local Contribution to Global Development”. . UAlgZine.
2023/09/15 - 2024/01/15. Curso / Disciplina lecionado. Genética Humana.. Ciências Biomédicas (Licenciatura). Universidade do Algarve.
Membro de associação. ICArEHB Theme Coordination. "Emmergence of Complex Societies" Theme Coordinator .
2020/01/01 - 2024/08/31. Orientação. Reconstructing the environmental and agricultural history of the Pre-Aksumite:
A multiple palaeobotanical and Environmental proxies.Archaeology (Doutoramento). Orientador.
2024/02/01 - 2024/06/30. Curso / Disciplina lecionado. Archaeogenetics. Arqueologia (Doutoramento). Universidade do Algarve.
2023/12/18. Júri de grau académico. Genomic analysis of emmer wheat: insights into domestication, dispersal and adaptation. . Presidente do júri. Alice Iob (Doutoramento). Universitat Autònoma de Barcelona.
2021/01/01 - 2023/09/30. Orientação. Algorithms to analyse Genotype-by-Sequencing of tetraploid wheat species..Bioinformática (Mestrado). Coorientador.
2023/07/12. Júri de grau académico. Jury for the final Undergraduate project, Biomedical Sciences BSc Degree (FMCB, Universidade do Algarve). . Arguente principal. Linda Inês Geraldo (Outro). Universidade do Algarve.
2023/06/01 - 2023/06/30. Outro júri / avaliação. Jury member for the attribution of a PhD Research Grant within the project 2022.07737.PTDC – ParaFunction (UAlg). . Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2023/06/01 - 2023/06/30. Outro júri / avaliação. Jury member for the attribution of a Master’s Research Grant within the project 2022.07737.PTDC – ParaFunction (UAlg). . Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2023/02/01 - 2023/06/30. Curso / Disciplina lecionado. Sustentabilidade e Colapso de Sociedades no Passado. Património Cultural e Arqueologia (Licenciatura). Universidade do Algarve.
2022/10 - 2022/10. Organização de evento. Sociedade Portuguesa de Genética. Hot-Topics Seminar Sessions. Ancient DNA: Genomics meets Archaeology (October 2022). I set-up the topic, invited the speakers and moderated this seminar session.
https://www.spgenetica.pt/c%C3%B3pia-q-a-cycle-1
(2022). Sociedade Portuguesa de Genética Humana.
2022/09 - 2022/09. Organização de evento. ICArEHB Prehistoric Archaeology Thinktank (PATH). Co-evolution during the domestication of plants and animals (September 2022). With Roz Gillis (DAI) and Marta Dal Corso (University of Kiel), I coordinated a 4-day meeting in Faro aimed at producing a ground-breaking reflection on domestication. As a result, a special volume on the topic will be proposed in the journal Proceedings of the Royal Society B. (2022). Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2022/07/01 - 2022/07/02. Outro júri / avaliação. Jury for attribution of a Post-Doctoral Research Grant (PDRG) within the DOPE project (ICArEHB). . Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2022/07/01. Júri de grau académico. Jury for the final Undergraduate project, Biomedical Sciences BSc Degree (FMCB, Universidade do Algarve). . Arguente principal. Raquel Coelho Reis (Outro). Universidade do Algarve.
2022/01/01 - 2022/06/30. Outro júri / avaliação. Jury for the Estácio da Veiga Prize for Archaeology and Human Evolution (ICArEHB-FCHS, Universidade do Algarve).. Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2022/02/01 - 2022/06/30. Curso / Disciplina lecionado. Arqueociências.. Património Cultural e Arqueologia (Licenciatura). Universidade do Algarve Faculdade de Ciências Humanas e Sociais.
2022/05 - 2022/05. Organização de evento. Training In Frontier Archaeology (TIFA) 3-day course on Genetics for Archaeologists (May 2022). I prepared the contents, theoretical, laboratory and computer sessions for the course and taught some of the modules. The course ran for 18 hours and included international speakers and participants.
http://www.icarehb.com/icarhub/tifa/genetics/
(2022). Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2021/02/01 - 2021/06/30. Curso / Disciplina lecionado. Biomolecular Archaeology. Arqueologia (Doutoramento). Universidade do Algarve.
2020/01/10 - 2020/12/31. Curso / Disciplina lecionado. Biomolecular Archaeology. Arqueologia (Doutoramento). Universidade do Algarve.

Projetos

Projetos
2022/01/15 - 2025/01/15. Domestication of the Opium poppy in Prehistoric Europe (DOPE). Investigador responsável. Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2022/01/01 - 2025/06/30. POPPY-Early History of the Opium Poppy in Europe and Southwestern Asia, AAPG2021. Investigador. Muséum National d'Histoire Naturelle.
2019/04/01 - 2024/03/31. OWLDER - Old World Legume Domestication, Evolution and Resources, CEEC-2018. Investigador responsável. Universidade do Algarve Centro Interdisciplinar de Arqueologia e Evolução do Comportamento Humano.
2021/01 - 2022/12. Boca do Rio: um sítio pesqueiro entre dois mares (BRIO)., PIPA. Co-Investigador Responsável (Co-IR). Universidade do Algarve Faculdade de Ciências Humanas e Sociais.
2015 - 2018. Life in a cold climate: the adaptation of cereals to new environments and the establishment of agriculture in Europe, FP7-IDEAS-ERC - Specific programme: "Ideas" implementing the Seventh Framework Programme. Bolseiro de Integração na Investigação. The University of Manchester Manchester Institute of Biotechnology.
2016 - 2016. Phenomics of wheat and barley domestication, National Capability in Crop Phenotyping. Co-Investigador Responsável (Co-IR). University of Wales Aberystwyth Institute of Biological Environmental and Rural Sciences.
2013 - 2014. History of rye cultivation in Europe. Bolseiro de Integração na Investigação. Nordiska museet.
2012 - 2012. Rye (Secale cereale L.) domestication and spread. Bolseiro de Integração na Investigação. Linköpings universitet.
2012 - 2012. Genomic analysis of historical rye accessions. Bolseiro de Integração na Investigação. Nordiska museet.
2011/01/01 - 2011/12/31. AGRISWESTMED. Bolseiro de Pós-Doutoramento. National Institute of Agricultural Botany.
2011 - 2011. Genomic analysis of wheat herbaria accessions. Bolseiro de Integração na Investigação. University of Cambridge McDonald Institute for Archaeological Research.
2006/10 - 2010/11. PhD Grant.

Produções

P. Larsson; H. R. Oliveira; M. Lundström; J. Hagenblad; P. Lagerås; M. W. Leino. 2019. "Population genetic structure in Fennoscandian landrace rye (Secale cereale L.) spanning 350 years". Genetic Resources and Crop Evolution, 66 (5): 1059-1071. https://doi.org/10.1007/s10722-019-00770-0
Hughes, Nathan; Oliveira, Hugo R.; Fradgley, Nick; Corke, Fiona M. K.; Cockram, James; Doonan, John H.; Nibau, Candida. 2019. "µ
CT
trait analysis reveals morphometric differences between domesticated temperate small grain cereals and their wild relatives". The Plant Journal, 99 (1): 98-111. https://doi.org/10.1111/tpj.14312
Lister, Diane L.; Jones, Huw; Oliveira, Hugo R.; Petrie, Cameron A.; Liu, Xinyi; Cockram, James; Kneale, Catherine J.; Kovaleva, Olga; Jones, Martin K.. 2018. "Barley heads east: Genetic analyses reveal routes of spread through diverse Eurasian landscapes". PLOS ONE, 13 (7). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0196652
Leigh, F.J.; Mackay, I.; Oliveira, H.R.; Gosman, N.E.; Horsnell, R.A.; Jones, H.; White, J.; Powell, W.; Brown, T.A.. 2013. "Using diversity of the chloroplast genome to examine evolutionary history of wheat species". Genetic Resources and Crop Evolution, 60 (6): 1831-1842. https://doi.org/10.1007/s10722-013-9957-4
Leigh, F.J.; Oliveira, H.R.; Mackay, I.; Jones, H.; Smith, L.; Wolters, P.; Charles, M.; et al. 2013. "Remnant genetic diversity detected in an ancient crop: Triticum dicoccon Schrank landraces from Asturias, Spain". Genetic Resources and Crop Evolution, 60 (1): 355-365. https://doi.org/10.1007/s10722-012-9840-8
Oliveira, H.R.; Civán, P.; Morales, J.; Rodríguez-Rodríguez, A.; Lister, D.L.; Jones, M.K.. 2012. "Ancient DNA in archaeological wheat grains: Preservation conditions and the study of pre-Hispanic agriculture on the island of Gran Canaria (Spain)". Journal of Archaeological Science, 39 (4): 828-835. https://doi.org/10.1016/j.jas.2011.10.008
Oliveira, Hugo R.; Campana, Michael G.; Jones, Huw; Hunt, Harriet V.; Leigh, Fiona; Redhouse, David I.; Lister, Diane L.; Jones, Martin K.. 2012. "Tetraploid Wheat Landraces in the Mediterranean Basin: Taxonomy, Evolution and Genetic Diversity". PLoS ONE, 7 (5). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0037063
Oliveira, H.R.; Jones, H.; Leigh, F.; Lister, D.L.; Jones, M.K.; Peña-Chocarro, L.. 2011. "Phylogeography of einkorn landraces in the Mediterranean basin and Central Europe: Population structure and cultivation history". Archaeological and Anthropological Sciences, 3 (4): 327-341. https://doi.org/10.1007/s12520-011-0076-x
Pereira, L.G.; Coimbra, S.; Oliveira, H.; Monteiro, L.; Sottomayor, M.. 2006. "Expression of arabinogalactan protein genes in pollen tubes of Arabidopsis thaliana". Planta, 223 (2): 374-380. https://doi.org/10.1007/s00425-005-0137-4
Oliveira, Hugo; Jackocks, L; Kennedy, SL; Czajkowska, B; Brown, TA. 2020. "Multiregional origins of the domesticated tetraploid wheats". PLOS ONE. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0227148
Czajkowska, Beata I.; Oliveira, Hugo R.; Brown, Terence A.. 2019. "A discriminatory test for the wheat B and G genomes reveals misclassified accessions of Triticum timopheevii and Triticum turgidum". PLOS ONE, 14 (4). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0215175
Oliveira, Hugo. 2019. "The Geography of Crop Origins and Domestication: Changing Paradigms from Evolutionary Genetics". https://doi.org/10.17863/CAM.38308
Hagenblad, Jenny; Oliveira, Hugo R.; Forsberg, Nils E. G.; Leino, Matti W.. 2016. "Geographical distribution of genetic diversity in Secale landrace and wild accessions". BMC Plant Biology, 16 (1). https://doi.org/10.1186/s12870-016-0710-y
Monteiro, Filipa; Vidigal, Patrícia; Barros, André B.; Monteiro, Ana; Oliveira, Hugo R.; Viegas, Wanda. 2016. "Genetic Distinctiveness of Rye In situ Accessions from Portugal Unveils a New Hotspot of Unexplored Genetic Resources". Frontiers in Plant Science, 7. https://doi.org/10.3389/fpls.2016.01334
Oliveira, Hugo R.; Tomás, Diana; Silva, Manuela; Lopes, Susana; Viegas, Wanda; Veloso, Maria Manuela. 2016. "Genetic Diversity and Population Structure in Vicia faba L. Landraces and Wild Related Species Assessed by Nuclear SSRs". PLOS ONE, 11 (5). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0154801
Tomás, Diana; Dias, Ana; Silva, Manuela; Oliveira, Hugo; Suso, Maria; Viegas, Wanda; Veloso, Maria. 2016. "Genetic Diversity Assessment of Portuguese Cultivated Vicia faba L. through IRAP Markers". Diversity, 8 (4). https://doi.org/10.3390/d8020008
Brown, Terence A.; Cappellini, Enrico; Kistler, Logan; Lister, Diane L.; Oliveira, Hugo R.; Wales, Nathan; Schlumbaum, Angela. 2014. "Recent advances in ancient DNA research and their implications for archaeobotany". Vegetation History and Archaeobotany, 24 (1): 207-214. https://doi.org/10.1007/s00334-014-0489-4
Oliveira, Hugo R; Hagenblad, Jenny; Leino, Matti W; Leigh, Fiona J; Lister, Diane L; Penã-Chocarro, Leonor; Jones, Martin K. 2014. "Wheat in the Mediterranean revisited – tetraploid wheat landraces assessed with elite bread wheat Single Nucleotide Polymorphism markers". BMC Genetics, 15 (1). https://doi.org/10.1186/1471-2156-15-54
Oliveira, Hugo. 2008. "Molecular Biology and the Human Past: a theory of archaeogenetics". Archaeological Review from Cambridge, 23 (1).
Oliveira, Hugo. 2015. "Wheat". Em Archaeology of food: an encyclopedia, editado por Karen Bescherer Metheny; Mary C. Beaudry, 544-545. Vol. 1. Estados Unidos: Rowman & Littlefield. https://rowman.com/ISBN/9780759123649/Archaeology-of-Food-An-Encyclopedia-2-Volumes
Oliveira, Hugo. 2015. "Rye". Em Archaeology of Food: An Encyclopedia, editado por Karen Bescherer Metheny; Mary C. Beaudry, 444-446. Vol. 2. Estados Unidos: Rowman & Littlefield. https://rowman.com/ISBN/9780759123649/Archaeology-of-Food-An-Encyclopedia-2-Volumes
Oliveira, Hugo. 2011. "Phylogeography of cereal landraces and the spread of agriculture in Northwest Africa. ". Em Windows on the African Past: Current Approaches to African Archaeobotany (Reports in African Archaeology), editado por Ahmed G. Fahmy; Stefanie Kahlheber; A. Catherine D'Andrea. Alemanha: Africa Magna Verlag.
Wright, Tally I.C.; Burnett, Angela C.; Griffiths, Howard; Kadner, Maxime; Powell, James S.; Oliveira, Hugo R.; Leigh, Fiona J.. 2020. "Identification of Quantitative Trait Loci Relating to Flowering Time, Flag Leaf and Awn Characteristics in a Novel Triticum dicoccum Mapping Population". Plants, 9 (7). https://doi.org/10.3390/plants9070829
Oliveira, Hugo Rafael. 2021. "The history of lentil (Lens culinaris subsp. culinaris) domestication and spread as revealed by Genotyping-by-Sequencing of wild and landrace accessions". Frontiers in Plant Sciences. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2021.628439/abstract
Drosou, Konstantina; Craig, Hayley; Palmer, Karren; Kennedy, Sandra L.; Wishart, John; Oliveira, Hugo R.; Civán, Peter; Martin, Peter; Brown, Terence A.. 2022. "The evolutionary relationship between bere barley and other types of cultivated barley". Genetic Resources and Crop Evolution, 69: 2361-2381. https://doi.org/10.1007/s10722-022-01377-8
 

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